首先让我们来看下求助的帖子:
还有以下用户和我们的QQ交流截图:
用户试用Simgen血凝块DNA试剂盒后采取的行动:
那么问题来了,Simgen试剂盒有什么魔力,用户试过后立马就下单了??!
我们先对比下两家公司产品的操作步骤:
可以看出来Simgen试剂盒和Tian***试剂盒操作步骤差异主要集中在过柱前(黄底色内容部分)的内容:Simgen采取的方案是:直接取血凝块用蛋白酶K融化,然后采用沉淀法取上清过柱纯化DNA;Tian***采取的方案比较复杂,但似乎只是参考了传统的方法(以液化柱替换了研钵研磨),收集沉淀物提取DNA。
用户是因为Tian***的操作步骤太复杂才选择Simgen试剂盒的吗,那倒未必,毕竟Tian***的市场知名度大于Simgen,DNA回收率的差异估计才是最重要的,那么Tian***到底在什么步骤损失了DNA呢?
我们来分析下血凝块形成的过程:血液凝块是指血液中红细胞在化学试剂、有毒物质、生物物质、温度等作用下聚合成为块状物的现象,凝块后血液由溶胶状态变为凝胶状态的血凝块,如在纤维蛋白的网状作用下将红细胞收在一起就形成了血液凝块(摘自百度百科)。当然这段话不完全正确,应该说纤维蛋白的网状作用下将红细胞和白细胞收在一起就形成了血凝块,为什么要强调白细胞呢,因为包括人在内的大多数哺乳动物红细胞是没有细胞核的,因而也没有核酸,只有白细胞有核,含有核酸。
因此血凝块更像是一块DNA含量很低的组织块,传统的处理思路是这样的:第一步是研磨血凝块(相当于组织的匀浆过程,Tian***则用液化柱替代了研磨血凝块的过程)破坏纤维蛋白的网状作用,释放血细胞,第二步是溶解红细胞,收集白细胞的细胞核。第三步就是取细胞核溶解,消化提取DNA。
如果血凝块是新鲜得到的,以上方法问题不大,但是如果把血凝块冷冻后结果会怎样呢?答案就是:损失掉大量的DNA!!!因为冻融的时候红细胞或者白细胞都会被冰晶刺破,导致大量DNA溶解在解冻后的血凝块所产生的血水中——Simgen实验室曾直接吸取血水提取过DNA,获得的DNA量大约是等体积抗凝血的一半,也就是说血凝块渗出的血水中就已经带走近1/4总量的DNA,在此基础上,如果继续加溶液(比如Tian***的CL溶液)清洗已经溶血的白细胞,则完全有可能再损失一半以上DNA的量。
Simgen血凝块试剂盒为什么DNA回收率高?有以下几点原因:
1. 选取的血凝块体积大。最多可以从400 mg(相当于400 μl体积的血凝块)血凝块中提取DNA。需要说明的是,形成400 μl体积的血凝块,至少需要800 μl体积血液,也就是说一次性相当于从800 μl全血中提取DNA。
2. 无研磨不洗涤的操作步骤。因为没有研磨血凝块以及洗涤细胞核的步骤,所以血凝块冻融与否都不会影响后续DNA的回收效率。
3. 国家发明专利技术的应用。如果把400 mg血凝块当做400 mg组织处理,通常会由于蛋白酶K不能彻底消化太多的蛋白质而导致后续过柱堵塞等问题。但是由于Simgen采用了其特有的国家发明专利技术沉淀样本中的各种蛋白(不论消化彻底与否),就非常巧妙地避开了过柱堵塞的难题。
最后我们看下用Simgen血凝块试剂盒从两个400 mg血凝块样本中提取的DNA效果(DNA用100 μl Buffer TE溶解洗脱)吧:
1、在微量紫外分光光度计上用Buffer TE调零,测量结果如下:
2、在1%的琼脂糖凝胶上,加入8 μl提取到的血凝块基因组DNA,电泳20分钟,效果如下:
是不是很心动呢?可以扫一扫下面的二维码观看血凝块DNA提取的操作视频,或者在Simgen网站(www.simgen.cn)索取免费的试用装哦。
Simgen生物实验室
2019.11.19