异硫氰酸胍法
取1 g叶片,液氮下充分研磨,迅速转移至离心管,加入3 mL 异硫氰酸胍提取液(4M异硫氰酸胍、2.5 M柠檬酸钠,pH7.0,0.5 %十二烷基肌氨酸钠,0.1 M巯基乙醇) 混匀。再依次加入0.3 mL 2 M NaAc (pH 4.0),3 mL水饱和酚和0.6 mL 氯仿/ 异戊醇(49∶1) ,混匀后冰浴15 min。4 ℃,12 000 r/ min 离心20 min。上清液加入等体积苯酚/ 氯仿再次抽提,离心,上清液加入等体积异丙醇,-20 ℃沉淀RNA。4 ℃,12000r/ min 离心10 min。75 %乙醇洗涤两次,100 %乙醇脱水。溶于100μl DEPC 重蒸水中。
尿素法
取1 g叶片,加入过量液氮充分研磨,快速转入离心管,加入6~8倍体积的裂解缓冲液(7 M 尿素,50 mM Tris-Cl ,pH8.0,10 mM Na2EDTA ,pH 8.0,3.5 M NaCl ,6.25 %Tris 饱和酚,pH 8.0 ,0.1 % SDS + 0.1 % LDS) ,轻轻搅拌后,0 ℃冰浴20 min。4 ℃,12000 r/ min离心15 min。上清液加1/ 3 体积3 M NaAc (pH5.3) ,1/ 5 体积的氯仿/ 异戊醇(24∶1),混匀后0 ℃冰浴20 min。4 ℃,12000 r/ min 离心15 min。上清液加入等体积冰浴冷却的异丙醇,冰浴10 min。4 ℃,5000 r/min 离心10 min。沉淀溶于5 mL 含有0.1 % SDS 的TE 缓冲液中,加入8M LiCl 至终浓度2.5 M,冰浴3 h 。4 ℃,12000 r/min 离心10min。75 %乙醇洗涤沉淀两次,空气干燥后溶于DEPC 处理水中。
Tris - 硼酸法
离心管中加15 mL 提取缓冲(150 mMTris ,50 mM EDTA ,4 % SDS ,硼酸调pH 至7.5) 和10μl 巯基乙醇,加热到65 ℃。1 g叶片充分研磨后转移到离心管中混匀, 65 ℃, 1min。室温放置5 min。加1.5 mL 5 MKAc ,4 mL乙醇,涡旋。20 mL 氯仿/ 异戊醇( 24∶1) 混匀后,8000 r/min 离心20 min。上清液加入10 mL 苯酚和10 mL 氯仿/ 异戊醇,10000 r/min ,10 min。上清液中加入0.3 倍体积12 M LiCl 混匀, - 20 ℃过夜。10000 r/min ,1 min。沉淀溶于10 mL 3 MLi2Cl 中,10000 r/ min ,10 min。沉淀溶于470μl DEPC 重蒸水,加30μl 5M KAc ,等体积氯仿/ 异戊醇抽提,10000 r/ min ,5 min。上清液转入两倍体积的乙醇中- 20 ℃沉淀RNA。4 ℃,10 000r/ min 离心20 min。沉淀干燥后溶于100 μl DEPC 重蒸水中。