一、实验目的:
从种子中提取DNA。
二、实验材料:
黄豆、面粉、研钵、植物DNA试剂盒(Simgen,Cat.No.3201050)
三、实验方法:
本次实验采用Simgen的植物DNA试剂盒方法来提取种子中的DNA,步骤如下:
1. a.黄豆:
称取黄豆1颗(约200mg),放入研钵中研磨至粉末状,加入1.5 ml 65℃预热的Buffer PL,继续研磨,分别吸取600 μl溶解物加入2个1.5 ml 离心管(相当于每次从约100mg 黄豆中提取DNA);
b.面粉(小麦粉):
2个1.5 ml 离心管中分别称取100mg和200mg面粉,加入500ml 65℃预热的Buffer PL,旋涡震荡至充分溶解;
2. 65℃水浴10分钟,水浴期间每隔2~3分钟翻转离心管数次以帮助DNA的释放;
3. 加入350 μl Buffer K,盖上管盖,用力摇晃15秒,旋涡振荡30秒。13000 rpm离心5分钟;
4.将离心上清液倒入核酸纯化柱中,离心去滤液;
5. 依次用500 μl Buffer WA和600 μl Buffer WB过柱洗涤;
6. 最高速离心,去除纯化柱上残留的乙醇;
7. 将核酸纯化柱置于一个洁净的1.5ml离心管中,用60 μl 65℃预热的Buffer TE 洗脱DNA;
8. 在微量紫外分光光度计上测量DNA的浓度;
9. 琼脂糖凝胶电泳。
四、实验结果:
1. 在微量紫外分光光度计上用Buffer TE调零,测量洗脱下来的DNA,结果如下:
2. 在0.6%的琼脂糖凝胶上,加入8μl提取到的DNA,电泳30 分钟,结果如下:
1、2:大豆DNA 3:100 mg面粉提取的DNA 4:200 mg面粉提取的DNA M:DL15000 DNA Marker
五、讨论与分析:
1.用Simgen植物DNA试剂盒能提取到黄豆、面粉(小麦粉)的DNA,说明在干燥的种子中,DNA保存得比较完整。
2.面粉DNA的电泳条带显示有明显的拖尾现象,产生了类似凋亡细胞的DNA带型。推测是由于种子被磨碎后,DNA更容易失去组蛋白的保护,从而形成凋亡细胞的DNA带型。
3.由于植物种子中DNA含量较低,可适度提高样本的用量(以面粉DNA提取为例),但样本用量不应大于200mg。以200 mg面粉提取DNA为例,样本加入裂解液(Buffer PL)水浴后变得非常粘稠,操作变得困难,且DNA回收量与100mg相比也没有成倍地增长。
4.植物种子通常会含有大量的蛋白、油脂、多糖(淀粉为主),Simgen植物DNA试剂盒在提取过程中能很好地抵御这些干扰。
Simgen实验室