回收不到质粒DNA或者质粒DNA的回收效率低
可能的原因:
1) Buffer W2中未加入无水乙醇,应按比例补加无水乙醇。如果是错误地加入了其他试剂,请向我公司技术部寻求帮助。
2) Buffer W2中错误地加入了70%乙醇。请向我公司技术部寻求帮助。
3) 细菌培养物中污染有真菌或其他杂菌(!注意:只针对原核生物起作用的抗生素对真菌无效)。确保从新鲜制备的含抗生素的平板中挑取单克隆菌落接种培养。
4) 质粒未转化到宿主菌中。确保从新鲜制备的含抗生素的平板中挑取单克隆菌落接种培养,并确保在培养基中加入对应的抗生素。
5) 不要吸取储存的甘油菌直接进行细菌培养。具体参考第3页“起始样本”内容。
6) 分离纯化的是低拷贝质粒。请选择质粒小提中量试剂盒,加大菌液用量提取质粒DNA。
7) Buffer II有白色沉淀产生。如有沉淀则应将Buffer II置于37℃水浴直至沉淀溶解后再使用。
8) Buffer II使用完后未盖紧瓶盖,与空气长期接触导致溶菌效率下降。请制备新鲜的Buffer II:1% SDS, 0.2M NaOH。
9) 菌体未悬浮充分。菌体未悬浮充分前勿加入Buffer II。
10) 错误地使用了Buffer W1和Buffer W2的洗涤顺序。确保按正确的顺序洗涤纯化柱。
11) DNA的洗脱效率差。参考第5页柱纯化技术中的第4点“洗脱质粒DNA”内容优化DNA的洗脱方案。
质粒上插入的基因的表达产物对细菌有毒性,影响了细菌的正常生长。