前段时间，实验室的一瓶未使用过的 YPD 培养基发现染菌了，出现了一大朵类似蘑菇的真菌，形态奇异。想着好好的培养基不能白白浪费了，要让这偷吃的真菌付出代价，于是小新决定提取这个未知真菌的 DNA。（另外，对这种真菌有所了解的小伙伴可以在评论区留言，让小新知道这个可恶的家伙叫什么。）
一、实验目的：
使用Simgen植物DNA试剂盒提取污染YPD 培养基的未知真菌。（具体详见说明书）
三、实验样本：
污染YPD 培养基的未知真菌。
四、实验结果：
（一）DNA 提取环节
1.在超微量分光光度计上用 Buffer TE 调零，测量提取好的 DNA，结果如下：
2.在 1%的琼脂糖凝胶上，加入 5 μl 提取到的 DNA，电泳 15 分钟，结果如下：
从浓度测量结果分析可知，植物/真菌 DNA 提取试剂盒成功提取出了未知真菌的 DNA，且浓度颇高。但是 A260/A280 比值达到 2.00，推测提取的 DNA 里面含有大量 RNA 或者降解的 DNA。经电泳图验证，确实存在大量拖带，与测量所得数据相符合。
（二）DNA 处理纯化环节
1.在超微量分光光度计上用 Buffer TE 调零，测量提取好的 DNA，结果如下：
表二：经 RNase A 处理过的未知真菌的 DNA 浓度
2.在 1%的琼脂糖凝胶上，加入 5 μl 提取到的 DNA 电泳 25 分钟，结果如下：对比表二和表一数据可以看到，经过RNase A 处理后 DNA 溶液的浓度减少了 10 倍以上，说明之前提取的 DNA 中含有大量的 RNA。从电泳图可以看到，经过 RNase A 处理后，拖带变少了，这是因为其中的大量 RNA 被降解去除了。但是拖带情况仍旧存在，说明其中含有一部分降解的 DNA。
1.本次实验成功提取到了未知真菌样本的 DNA，从图二可以明显看到，虽然有部分降解，但提取的 DNA 主带清晰可见。
2.对比样本 1 和样本 2 的数据可以看到，两管样本的 DNA 浓度相差了 2 倍左右，推测可能是因为研磨时该真菌样本中存在较多的颗粒物质，在提取步骤3 转移到离心管时，第一个样本吸取的大多是上清液，第 2 个样本吸取了较多底部的这种颗粒，使得两管样本最后提取的 DNA 数据相差较大。
3.从表一和表二数据分析可知，该未知真菌提取的 DNA 中含有大量的 RNA，占了总浓度的 90%以上，相对来说 DNA 含量比较少，平均 500 mg 样本中只有约 5.7 μg DNA。这也是真菌样本（比如酵母）的共通点：DNA 含量较少而RNA 含量高，因此建议大家在提取真菌时尽可能的多加样本，确保能提到足够的 DNA，并且在提取步骤 3 中补加 RNase A 储存液（Simgen Cat. No. 8001001）用以消化 RNA。
