如何从种子中提取DNA(技术文章)

作者:新景实验室
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实验目的:

从种子中提取DNA

实验材料:黄豆、面粉、研钵、植物DNA试剂盒(SimgenCat.No.3201050

实验方法:

本次实验采用Simgen植物DNA试剂盒方法来提取种子中的DNA,步骤如下:

1. a.黄豆:

称取黄豆1颗(约200mg),放入研钵中研磨至粉末状,加入1.5 ml 65℃预热的Buffer PL,继续研磨,分别吸取600 μl溶解物加入21.5 ml 离心管(相当于每次从约100mg 黄豆中提取DNA

   b.面粉(小麦粉):

21.5 ml 离心管中分别称取100mg200mg面粉加入500ml 65℃预热的Buffer PL,旋涡震荡至充分溶解;

2. 65℃水浴10分钟,水浴期间每隔2~3分钟翻转离心管数次以帮助DNA的释放

3. 加入350 μl Buffer K,盖上管盖,用力摇晃15秒,涡振荡30秒。13000 rpm离心5分钟;

4.将离心上清液倒入核酸纯化柱中,离心去滤液

5. 依次用500 μl Buffer WA600 μl Buffer WB过柱洗涤;

6. 最高速离心,去除纯化柱上残留的乙醇;

7. 将核酸纯化柱置于一个洁净的1.5ml离心管中,60 μl 65℃预热的Buffer TE 洗脱DNA

8. 在微量紫外分光光度计上测量DNA的浓度;

9. 琼脂糖凝胶电泳。

实验结果:

1. 在微量紫外分光光度计上用Buffer TE调零,测量洗脱下来的DNA,结果如下


2. 0.6%的琼脂糖凝胶上,加入8μl提取到的DNA,电泳30 分钟,结果如下


讨论与分析:

1.Simgen植物DNA试剂盒能提取到黄豆、面粉(小麦粉)的DNA,说明在干燥的种子中,DNA保存得比较完整。

2.面粉DNA的电泳条带显示有明显的拖尾现象,产生了类似凋亡细胞的DNA带型。推测是由于种子被磨碎后,DNA更容易失去组蛋白的保护,从而形成凋亡细胞的DNA带型

3.由于植物种子中DNA含量较低,可适度提高样本的用量(以面粉DNA提取为例)但样本用量不应大于200mg200 mg面粉提取DNA为例,样本加入裂解液(Buffer PL)水浴后变得非常粘稠,操作变得困难,且DNA回收量与100mg相比也没有成倍地增长。

4.植物种子通常会含有大量的蛋白、油脂、多糖(淀粉为主),Simgen植物DNA试剂盒在提取过程能很好地抵御这些干扰。

Simgen实验室