如何从血凝块中提取DNA

作者:新景实验室
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一.实验目的:

从血凝块中提取DNA

二.实验材料:

两个血凝块样本、手术刀、血凝块DNA纯化试剂盒(SimgenCat.No.42010502×Taq Plus PCR Master MixSimgenCat.No.7005100)、Human β-globin gene引物(ForwardTTAGGCCTTAGCGGGCTTAGACReverseCCAGGATTTTTGATGGGACACG)。

三.实验方法:

本次实验采用Simgen的血凝块DNA纯化试剂盒方法来提取血凝块DNA,步骤如下:

1. 用手术刀切取300~400 mg血凝块,转移血凝块到1.5 ml离心管中

2. 根据血凝块的体积(按1 mg =1 μl换算),补加Buffer PL至终体积为500 μl

3. 加入20 μl蛋白酶K贮存液,再加入15 μl Buffer SP,旋涡振荡约15秒混匀。

4. 56°C水浴15分钟;

5. 加入375 μl Buffer L1,盖上管盖,旋涡振荡30

6. 加入375 μl Buffer L2,剧烈摇晃离心管3~5次,再旋涡振荡30秒混匀。 13000 rpm 离心5分钟;

7. 吸取750 μl离心上清液加入核酸纯化柱中,离心去滤液;

8. 依次用500 μl Buffer WA600 μl Buffer WB过柱洗涤;

9. 最高速离心,去除纯化柱上残留的乙醇;

10.将核酸纯化柱置于一个洁净的1.5 ml 离心管中,用60 μl 56℃预热的Buffer TE洗脱DNA

11.在微量紫外分光光度计上测量DNA的浓度;

12.2×Taq Plus PCR Master Mix扩增Human β-globin gene,目的基因长约1.3kb

13.琼脂糖凝胶电泳。

四.实验结果:

1.在微量紫外分光光度计上用Buffer TE调零,测量洗脱下来的DNA,结果如下:


2.1%的琼脂糖凝胶上,加入8 μl提取到的血凝块基因组DNA,电泳20分钟,结果如下:

MDL15000 DNA Marker

12:血凝块DNA

3.1%的琼脂糖凝胶上,加入5μl PCR 扩增产物,电泳15分钟,结果如下:

MDL2000 DNA Marker

1:阳性对照扩增产物

23:血凝块DNA扩增产物

五.实验结论:

1.Simgen血凝块DNA纯化试剂盒从约350mg血凝块中提取到了约10μg DNADNA的纯度很好,A260/A280接近1.8;盐分残留很低,A260/A230接近2.5

2.基因组DNA电泳检测显示比较完整,拖尾较少,主带明显。

3.从血凝块中提取到的基因组DNA用作模板进行PCR扩增,效果良好。

六.讨论:

市场上大部分品牌的血凝块DNA提取试剂盒在提取DNA前都需要将预先血凝块研磨再提取DNA,操作极为不便,并且提取到的DNA有降解现象(见网址链接http://www.dxy.cn/bbs/topic/33224165?source=rss)。Simgen血凝块DNA纯化试剂盒由于采用了其专利技术(国家发明专利号: ZL 201410377744.5),可容忍血凝块样本溶解不完全的前提下提取DNA,所以无需研磨步骤,只需用蛋白酶K消化血凝块即可,操作起来相对而言非常简便快速