通用型基因组DNA试剂盒性能大比拼

作者:新景实验室
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自从上次实测快速通用型基因组DNA提取试剂盒的性能文章发布后,已经有很多客户向我们申请了试用装,使用的反馈效果也不错。其中生物科技有限公司更是做了多家试剂盒的测试对比,接下来小新就将该公司测试的结果分享给大家,毕竟产品自测的效果难免让人怀疑有做广告的嫌疑,第三方的测试才会显得公平公正。

 

 

一、 实验材料

试剂盒:**赞(DC112-01)、**金(EE101-01)、*根(KG203)、新景(3105005)、*为(CW2298M

样本:小鼠肌肉、猪血、大肠杆菌(DH5α)、夹竹桃叶片

 

二、 实验方法

1. 样本处理:

A. 小鼠肌肉:称取20 mg,液氮研磨成粉;

B. 猪血:取200 μl全血;

C. 大肠杆菌(DH5α):1.5 ml菌液离心取细菌沉淀;

D. 夹竹桃叶片:称取100 mg,液氮研磨成粉。

2. 按照各试剂盒说明书操作,提取DNA

3. 用超微量分光光度计测量提取的DNA,并进行电泳检测和Qubit检测。

 

三、 实验结果

1. 超微量分光光度计测量结果如下:


2. 电泳检测结果如下:



3.Qubit检测结果如下:


四、 分析与讨论

1. 从超微量分光光度计测量结果看,小鼠肌肉样本提取效果最好的是**赞,猪血样本提取效果最好的是**赞,大肠杆菌样本提取效果最好的是*为,夹竹桃叶片样本提取效果最好的新景。

2. 从电泳结果看,小鼠肌肉样本提取效果最好的是新景,猪血样本提取效果最好的是**赞和新景,大肠杆菌样本提取效果最好的是**赞,夹竹桃叶片样本提取效果最好的新景。(*根试剂盒提取的样本电泳均未显示条带,但浓度高的原因是该试剂盒为快速样品制备试剂盒,样本裂解处理后DNA已经降解成小片段,虽然可以直接用作qPCR检测,但电泳已经观察不到DNA条带。)

3. Qubit检测结果看,小鼠肌肉样本提取效果最好的是**赞,猪血样本提取效果最好的是新景,大肠杆菌样本提取效果最好的是*为,夹竹桃叶片样本提取效果最好的新景。

4. 三种检测结果的差异性说明了分光光度计检测方法的局限性,因为紫外吸光度测量不具有选择性,无法区分DNARNA或蛋白质,同时一些游离核苷酸或多余的盐离子也会影响检测的数值。比如虽然从超微量分光光度计测量结果分析,大肠杆菌样本提取效果最好的是*,但是电泳的结果却是新景和*为的DNA条带亮度差不多,**赞的DNA条带反而更亮,并且*提取大肠杆菌DNA中污染有RNA

5. 对比超微量分光光度计测量结果和Qubit检测结果,可以发现新景和**金的试剂盒提取的DNA这两者的检测结果数值都很接近,差异比**赞和*为的试剂盒要小,说明新景和**金的试剂盒提取的DNA纯度更高RNA等杂质的含量很少(电泳也能观察到区别)

 

市场上常见的通用性基因组DNA提取试剂盒(包括**赞、*为等公司)所采用的技术方案都是模仿QIAGENDNeasy Blood & Tissue Kit 产品,简而言之就是蛋白酶K消化后加醇过柱,缺点是去除杂质效率比较差,且容易残留RNA。新景的快速通用型基因组DNA提取试剂盒则采用了全新独创的分相直接过柱技术,不仅操作步骤更简单,获得的DNA纯度更高,对复杂样本(血液、植物、粪便)也能轻松应对,必定会在不同厂家的通用型基因组DNA提取试剂盒竞争中脱颖而出。